Les humains sont des holobiontes

 Les holobiontes sont des organismes qui vivent en symbiose avec une communauté complexe de microorganismes. Cette communauté comprend des bactéries, des archées, des virus, des champignons et d'autres microbes, tous interagissant de manière intime avec l'hôte. Le concept de holobionte souligne que l'organisme hôte et ses microorganismes symbiotiques forment une unité écologique et fonctionnelle intégrée.

Symbiose

La relation entre l'hôte et ses microorganismes peut être mutuellement bénéfique (mutualisme), neutre (commensalisme) ou parfois nuisible (parasitisme). Cependant, dans le cadre des holobiontes, les interactions sont souvent mutualistes ou commensales, contribuant à la santé et au fonctionnement de l'hôte.

Microbiome

Le terme "microbiome" fait référence à l'ensemble des microorganismes et de leur matériel génétique présents dans un environnement particulier, comme le microbiome intestinal chez l'homme. Le microbiome est une composante essentielle des holobiontes, jouant des rôles cruciaux dans la digestion, l'immunité et d'autres fonctions physiologiques.

Coévolution 

Les hôtes et leurs microorganismes symbiotiques coévoluent souvent, développant des mécanismes d'adaptation spécifiques les uns aux autres. Par exemple, certaines bactéries intestinales ont évolué pour décomposer des nutriments spécifiques dans l'alimentation de l'hôte.

Santé et maladie 

Les holobiontes sont importants pour la santé globale de l'hôte. Un déséquilibre dans la composition du microbiome, connu sous le nom de dysbiose, peut conduire à diverses maladies, y compris des maladies inflammatoires, métaboliques et auto-immunes.

Diversité 

Les holobiontes varient largement entre les espèces et même entre les individus d'une même espèce. Cette diversité est influencée par des facteurs génétiques, environnementaux, alimentaires et de mode de vie.

Exemples de Holobiontes

Humains

Les humains, dont l'ancêtre est Luca, hébergent des trillions de microbes principalement dans l'intestin, mais aussi sur la peau, dans la bouche, et dans d'autres cavités corporelles. Ces microbes jouent des rôles essentiels dans la digestion, le métabolisme, la protection contre les pathogènes et le développement du système immunitaire.

Coraux 

Les coraux sont des holobiontes bien étudiés, vivant en symbiose avec des algues photosynthétiques appelées zooxanthelles. Ces algues fournissent des nutriments au corail grâce à la photosynthèse, tandis que le corail fournit un habitat protégé et des composés nécessaires à la photosynthèse.

Plantes

De nombreuses plantes forment des holobiontes avec des champignons mycorhiziens et des bactéries fixatrices d'azote. Ces symbiotes aident les plantes à absorber les nutriments du sol et à fixer l'azote de l'air, respectivement.